Молодые ученые Санкт-Петербургского государственного университета совместно с ассистент-профессором Университета Карнеги — Меллон (США) Хосейном создали компьютерную программу, которая значительно ускоряет поиск новых антибиотиков.
В исследовательскую группу входили сотрудники Центра алгоритмической биотехнологии петербургского университета под руководством Павла Певзнера, сообщает пресс-служба СпбГУ.
Как рассказал доцент СПбГУ, кандидат физико-математических наук Антон Коробейников, компьютерный алгоритм, получивший название VarQuest позволяет быстро сравнивать две базы данных. Одна из них представляет собой химические структуры известных биологически активных природных соединений. Другая физические замеры (масс-спектры) веществ, которые производят исследуемые микроорганизмы.
«В каждой базе данных — десятки тысяч соединений, и наш алгоритм оперативно находит похожие пары, — отметил Антон Коробейников. — Обнаружив новое соединение, похожее на известное биологически активное вещество, ученые могут подвергнуть его более детальной проверке. Есть предположение, что обнаруженное новое соединение будет эффективнее с фармакологической точки зрения, чем его более изученные аналоги, представленные в базе данных».
Одна из наиболее серьезных проблем в современной фармакологии — это выработка у болезнетворных бактерий «иммунитета» к известным антибиотикам.
Поэтому быстрое создание новых лекарств приобретает решающее значение в медицине.
Стоит отметить, что это исследование чрезвычайно важно для возрождения производства антибиотиков в России. В 1960 годах советские исследования в данной сфере были на передовом рубеже науки.
В 1985 году СССР произвел 2300 тонн антибиотиков, а в 2005-м производство антибиотиков на собственном сырье в России было полностью остановлено.
Комментарии